41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5504 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5504  phage terminase, small subunit, , P27 family  100 
 
 		 144 aa  292  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  38.46 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  32.77 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0286  P27 family phage terminase small subunit  32.77 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1369  P27 family phage terminase small subunit  34.45 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.369715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  34.51 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  33.64 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2064  P27 family phage terminase small subunit  29.46 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  33.04 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  33.66 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1617  phage terminase, small subunit, putative, P27  33.96 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207143  normal  0.415042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1473  phage terminase, small subunit, putative, P27  33.02 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.889427  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1615  P27 family phage terminase small subunit  37.17 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.415923  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1454  phage terminase, small subunit, , P27 family  31.73 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1288  P27 family phage terminase small subunit  26.5 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  31.03 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0465  phage terminase, small subunit  28.04 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.371651 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  27.93 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  28.97 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3988  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.69 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0839  phage terminase, small subunit, putative, P27  30.91 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00189834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1320  P27 family phage terminase small subunit  30.91 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000502965  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1659  putative phage terminase, small subunit, P27 family  33.64 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7333  phage terminase, small subunit, , P27 family  29.85 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0220  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.09 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2353  hypothetical protein  28.32 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0334  phage terminase, small subunit, putative, P27  26.13 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2021  phage terminase, small subunit, putative, P27  26.13 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  26.79 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  30.83 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1724  phage terminase, small subunit, putative, P27  26.96 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2597  P27 family phage terminase small subunit  24.07 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  25.66 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.85 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1185  P27 family phage terminase small subunit  22.95 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  hitchhiker  0.000000000518622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1966  Phage terminase protein  25.51 
 
 		 155 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358239  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3398  P27 family phage terminase small subunit  30 
 
 		 158 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.096573  hitchhiker  0.0000000756325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12668  phiRv2 prophage protein  28.28 
 
 		 163 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0871  Phage terminase protein  26.13 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2272  putative phage terminase, small subunit, P27 family  27.18 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621935  hitchhiker  0.0000000000000114171 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1651  hypothetical protein  26.67 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>