31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0465 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0465  phage terminase, small subunit  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.371651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  35.77 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3398  P27 family phage terminase small subunit  32.35 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.096573  hitchhiker  0.0000000756325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1288  P27 family phage terminase small subunit  31.76 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  30 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  28.67 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  35 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  28.86 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  27.88 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  25.97 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.6 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1615  P27 family phage terminase small subunit  28.75 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.415923  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  29.11 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0839  phage terminase, small subunit, putative, P27  33.83 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00189834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1320  P27 family phage terminase small subunit  33.83 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000502965  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1630  hypothetical protein  34.19 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2064  P27 family phage terminase small subunit  25 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5504  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.04 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.57 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0960  hypothetical protein  30.92 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0602496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  27.91 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  29.58 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12668  phiRv2 prophage protein  27.33 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0016  phage terminase, small subunit, P27 family  27.96 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1659  putative phage terminase, small subunit, P27 family  30.83 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1651  hypothetical protein  29.82 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1588  putative phage terminase, small subunit  31.71 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0296354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3974  hypothetical protein  25.19 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0829411 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  24.58 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1185  P27 family phage terminase small subunit  24.16 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  hitchhiker  0.000000000518622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4006  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  24.62 
 
 		 173 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>