54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0622 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  69.14 
 
 		 167 aa  236  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1454  phage terminase, small subunit, , P27 family  48.8 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1588  putative phage terminase, small subunit  39.02 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0296354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  30 
 
 		 161 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  31.79 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4006  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  30.36 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2597  P27 family phage terminase small subunit  28.48 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  31.94 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  36.63 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  31.1 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0016  phage terminase, small subunit, P27 family  30.54 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  32.17 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  29.63 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1185  P27 family phage terminase small subunit  25.66 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  hitchhiker  0.000000000518622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.24 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3316  putative terminase small subunit  33.12 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000140314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5504  phage terminase, small subunit, , P27 family  32.77 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1288  P27 family phage terminase small subunit  28.57 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1615  P27 family phage terminase small subunit  28.4 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.415923  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  28.1 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0465  phage terminase, small subunit  27.88 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.371651 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1678  P27 family phage terminase small subunit  28.05 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2064  P27 family phage terminase small subunit  27.7 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145671 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.3 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  25.52 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1473  phage terminase, small subunit, putative, P27  33.01 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.889427  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1617  phage terminase, small subunit, putative, P27  33.01 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207143  normal  0.415042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2272  putative phage terminase, small subunit, P27 family  32.73 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621935  hitchhiker  0.0000000000000114171 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4095  hypothetical protein  34.86 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.537246  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3398  P27 family phage terminase small subunit  27.74 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.096573  hitchhiker  0.0000000756325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1659  putative phage terminase, small subunit, P27 family  28.05 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3807  hypothetical protein  34.86 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2236  hypothetical protein  34.86 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.236529  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0286  P27 family phage terminase small subunit  32.08 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4386  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  33.33 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1724  phage terminase, small subunit, putative, P27  28.43 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12668  phiRv2 prophage protein  29.25 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2968  phage terminase small subunit  28.83 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1651  P27 family phage terminase small subunit  27.78 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2268  putative phage terminase, small subunit, P27 family  32.41 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.753219  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1369  P27 family phage terminase small subunit  28.95 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.369715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2597  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.75 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115209  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7333  phage terminase, small subunit, , P27 family  24.68 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2021  phage terminase, small subunit, putative, P27  25.95 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0334  phage terminase, small subunit, putative, P27  25.95 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0220  phage terminase, small subunit, , P27 family  25.5 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5450  hypothetical protein  33.04 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1651  hypothetical protein  27.05 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2353  hypothetical protein  30.58 
 
 		 131 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0871  Phage terminase protein  22.31 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3988  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.77 
 
 		 125 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1078  phage terminase small subunit putative P27  27.72 
 
 		 101 aa  41.2  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1058  phage terminase, small subunit, putative, P27  27.72 
 
 		 101 aa  41.2  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>