45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4249 on replicon NC_014149
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  100 
 
 		 160 aa  330  4e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  35.4 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  37.17 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  32.45 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  32.65 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3398  P27 family phage terminase small subunit  33.96 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.096573  hitchhiker  0.0000000756325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  34.19 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  34.65 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1630  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2064  P27 family phage terminase small subunit  31.88 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1185  P27 family phage terminase small subunit  27.39 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  hitchhiker  0.000000000518622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  28.19 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0839  phage terminase, small subunit, putative, P27  31.58 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00189834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1320  P27 family phage terminase small subunit  31.58 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000502965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  27.27 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0465  phage terminase, small subunit  30.6 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.371651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1369  P27 family phage terminase small subunit  32.48 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.369715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0286  P27 family phage terminase small subunit  30.65 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1314  Phage terminase small subunit-like protein  28.71 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2274  Phage terminase small subunit-like protein  28.71 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1698  Phage terminase small subunit-like protein  28.71 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12668  phiRv2 prophage protein  32.12 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1588  putative phage terminase, small subunit  25 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0296354  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1615  P27 family phage terminase small subunit  30.84 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.415923  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  28.45 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  28.46 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5450  hypothetical protein  28.18 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0956  P27 family phage terminase small subunit  27.93 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.17 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0220  phage terminase, small subunit, , P27 family  25.74 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1724  phage terminase, small subunit, putative, P27  27.72 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1454  phage terminase, small subunit, , P27 family  24.43 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2968  phage terminase small subunit  26.89 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2021  phage terminase, small subunit, putative, P27  26.92 
 
 		 137 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1678  P27 family phage terminase small subunit  25 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2597  phage terminase, small subunit, , P27 family  27.73 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115209  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0334  phage terminase, small subunit, putative, P27  25.96 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1617  phage terminase, small subunit, putative, P27  30 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207143  normal  0.415042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1473  phage terminase, small subunit, putative, P27  30 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.889427  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5504  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.17 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0960  hypothetical protein  26.63 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0602496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0871  Phage terminase protein  25.41 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3988  phage terminase, small subunit, , P27 family  25.21 
 
 		 125 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  22.22 
 
 		 154 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1651  hypothetical protein  30.28 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>