42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5222 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  78.7 
 
 		 385 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  88.57 
 
 		 385 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  100 
 
 		 385 aa  795    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  93.25 
 
 		 385 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  85.48 
 
 		 385 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  97.8 
 
 		 385 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  88.31 
 
 		 385 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  97.8 
 
 		 385 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  38.87 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  39.08 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  38.38 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  36.54 
 
 		 383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  34.42 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  32.45 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  36.41 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  35.41 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  33.78 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  31.51 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  33.33 
 
 		 417 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  30.23 
 
 		 410 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  29.31 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.04 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.04 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.21 
 
 		 335 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.51 
 
 		 347 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.23 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1667 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.21 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.21 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.36 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  27.97 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.63 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  29.41 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.47 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.05 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.6 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.95 
 
 		 316 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.6 
 
 		 340 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.6 
 
 		 340 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.6 
 
 		 340 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>