32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0601 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  81.56 
 
 
385 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  90.91 
 
 
385 aa  705    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  799    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  94.13 
 
 
385 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  86.81 
 
 
385 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  93.68 
 
 
385 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  93.68 
 
 
385 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  91.17 
 
 
385 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  38.9 
 
 
385 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  38.28 
 
 
401 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  37.54 
 
 
383 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  35.59 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  35.92 
 
 
405 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  36.01 
 
 
409 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  31.73 
 
 
408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  35.41 
 
 
387 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  31.36 
 
 
386 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  34.21 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  31.29 
 
 
417 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  29.66 
 
 
410 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  25.82 
 
 
400 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.83 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.19 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.19 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  31.09 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.46 
 
 
335 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.21 
 
 
329 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.21 
 
 
329 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.48 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1935  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.36 
 
 
314 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.47 
 
 
329 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.68 
 
 
314 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>