21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0035 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  100 
 
 
408 aa  824    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  46.07 
 
 
409 aa  299  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  33.07 
 
 
385 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  33.07 
 
 
385 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  32.43 
 
 
385 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  33.33 
 
 
385 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  31.73 
 
 
385 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  32.7 
 
 
385 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  32.98 
 
 
405 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  32.15 
 
 
385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  32.7 
 
 
383 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  33.69 
 
 
385 aa  169  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  31.38 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  32.26 
 
 
401 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  30.11 
 
 
383 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  30.43 
 
 
386 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  32.38 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  28.89 
 
 
387 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  28.65 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  28 
 
 
400 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  27.38 
 
 
410 aa  120  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>