21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0160 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  799    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  45.28 
 
 
387 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  42.13 
 
 
386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  39.89 
 
 
391 aa  292  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  36.67 
 
 
383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  36.26 
 
 
385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  36.26 
 
 
385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  35.24 
 
 
401 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  37.61 
 
 
385 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  35.59 
 
 
385 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  36.36 
 
 
385 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  36.47 
 
 
385 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  35.82 
 
 
385 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  36.28 
 
 
385 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  33.33 
 
 
385 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  31.47 
 
 
405 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  32.69 
 
 
409 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  30.11 
 
 
408 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  26.88 
 
 
417 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  26.92 
 
 
400 aa  116  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  25.66 
 
 
410 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>