21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4730 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  100 
 
 		 417 aa  854    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  65.16 
 
 		 410 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  49.27 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  33.14 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  33.13 
 
 		 385 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  31.37 
 
 		 385 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  32.32 
 
 		 385 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  32.52 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  33.44 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  32.52 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  30.89 
 
 		 385 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  31.29 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  30.91 
 
 		 391 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  31.95 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  30.41 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  30.09 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  29.03 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  31.44 
 
 		 409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  28.39 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  30.57 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  26.86 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>