24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4080 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  100 
 
 
401 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  38.87 
 
 
385 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  38.28 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  38.28 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  38.28 
 
 
385 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  37.26 
 
 
385 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  37.05 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  36.05 
 
 
385 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  36.34 
 
 
385 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  35.22 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  37.13 
 
 
385 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  37.86 
 
 
387 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  33.52 
 
 
383 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  34.13 
 
 
386 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  32.71 
 
 
405 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  34.84 
 
 
391 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  37.18 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  32.84 
 
 
408 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  27.01 
 
 
400 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  30.41 
 
 
417 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  26.07 
 
 
410 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.72 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.08 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  30.6 
 
 
445 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0133679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>