21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1685 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  100 
 
 		 391 aa  791    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  62.21 
 
 		 386 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  54.4 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  39.89 
 
 		 383 aa  292  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  33.92 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  34.84 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  32.33 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  32.33 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  34.51 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  31.51 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  29.52 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  35.2 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  34.87 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  33.33 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  34.2 
 
 		 385 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  32.03 
 
 		 385 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  35.33 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  32.38 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  30.91 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  28.45 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  27.99 
 
 		 400 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>