21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2335 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  100 
 
 
409 aa  815    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  44.94 
 
 
408 aa  302  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  36.57 
 
 
385 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  36.57 
 
 
385 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  36.41 
 
 
385 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  35.4 
 
 
385 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  35.29 
 
 
385 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  36.01 
 
 
385 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  35.85 
 
 
385 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  35.57 
 
 
385 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  36.16 
 
 
387 aa  179  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  37.18 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  35.08 
 
 
386 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  33.67 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  32.46 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  32.69 
 
 
383 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  34.84 
 
 
383 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  35.33 
 
 
391 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  28.45 
 
 
400 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  31.44 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  27.11 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>