40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3809 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  801    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  80.78 
 
 
385 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  81.56 
 
 
385 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  81.04 
 
 
385 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  79.12 
 
 
385 aa  627  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  79.95 
 
 
385 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  79.95 
 
 
385 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  79.89 
 
 
385 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  38.58 
 
 
401 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  39.43 
 
 
385 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  35.65 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  36.47 
 
 
383 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  34.95 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  35.85 
 
 
409 aa  186  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  34.38 
 
 
387 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  30.79 
 
 
391 aa  169  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  31.38 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  31.37 
 
 
386 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  31.46 
 
 
417 aa  159  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  31.44 
 
 
410 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  28.79 
 
 
400 aa  119  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.79 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.98 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.97 
 
 
362 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 
328 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 
328 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  28.47 
 
 
329 aa  49.7  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.89 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.59 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.15 
 
 
324 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.93 
 
 
329 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.03 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.1 
 
 
329 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.1 
 
 
329 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  26.27 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.33 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.33 
 
 
340 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.33 
 
 
340 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.33 
 
 
340 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>