More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3528 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155886  normal  0.931237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.9 
 
 
272 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0568307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2610  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  91.91 
 
 
271 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.67 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.54 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
282 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  39.91 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.18 
 
 
532 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
258 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
264 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
285 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.266674  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  38.43 
 
 
263 aa  168  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
264 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22520  ABC transporter inner-membrane protein  43.24 
 
 
277 aa  168  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  38.66 
 
 
264 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
297 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4842  putative ABC transporter (permease protein)  42.26 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 
538 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
286 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.961582  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
286 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
263 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
536 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
532 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
287 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
264 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.7 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
270 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
270 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
270 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0133  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  40.19 
 
 
283 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.744619  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
270 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
265 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
264 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
270 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
265 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
289 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00938  alkanesulfonate transporter subunit  39.5 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.753275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2185  alkanesulfonate transporter permease subunit  39.5 
 
 
264 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11182  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2062  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  41.01 
 
 
280 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.332807  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
265 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
265 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1043  alkanesulfonate transporter permease subunit  39.5 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00945  hypothetical protein  39.5 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2662  alkanesulfonate transporter permease subunit  39.5 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  0.0100847 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1036  alkanesulfonate transporter permease subunit  39.5 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0685931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2159  sulfate ester ABC transporter inner membrane protein  41.43 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514359  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0265  ABC transporter permease  44.72 
 
 
538 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302657  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.39 
 
 
270 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
268 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
280 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
280 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1096  alkanesulfonate transporter permease subunit  39.08 
 
 
263 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00432775  normal  0.422148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  36.97 
 
 
262 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
265 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
566 aa  151  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0913088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
275 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  36.97 
 
 
262 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.55 
 
 
260 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
280 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  decreased coverage  0.0001708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  38.66 
 
 
268 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
272 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 
273 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
278 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 
269 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  40.91 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 
273 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 
273 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 
273 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 
537 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.300396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  40.91 
 
 
274 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  37.08 
 
 
279 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 
273 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
528 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 
273 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00657173  hitchhiker  0.00236959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.64 
 
 
282 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
286 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
270 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
276 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
283 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
284 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.64 
 
 
279 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
300 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
280 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
272 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88893  normal  0.0504928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
264 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
280 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
294 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
268 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  36.55 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
279 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
292 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.0430449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>