172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2130 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II2130  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  92.63 
 
 		 299 aa  354  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  92.63 
 
 		 299 aa  354  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  92.63 
 
 		 299 aa  354  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  92.63 
 
 		 299 aa  354  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  92.63 
 
 		 299 aa  354  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  92.63 
 
 		 299 aa  354  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3348  LysR family transcriptional regulator  81.18 
 
 		 306 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0103811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  79.03 
 
 		 306 aa  306  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 306 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  76.34 
 
 		 306 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  76.34 
 
 		 306 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  76.34 
 
 		 306 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5307  LysR family transcriptional regulator  76.34 
 
 		 306 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0037216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5936  transcriptional regulator, LysR family  73.8 
 
 		 302 aa  288  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 309 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 305 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 329 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 329 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 311 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 316 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 316 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 316 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 300 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 300 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 300 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 300 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 338 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 300 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 300 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 300 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 300 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 300 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2599  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 319 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 300 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 300 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 300 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1450  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.756367  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1408  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0263821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 310 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3819  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.37605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5141  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.730925 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5134  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  0.868057 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6018  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 320 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6670  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6318  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26270  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.338283  normal  0.903696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0988994 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7090  transcriptional regulator, LysR family  32.84 
 
 		 306 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3555  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6961  transcriptional regulator, LysR family  30.6 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0254  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.56957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 435 aa  58.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.63 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 320 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0207  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 306 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1301  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.828365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.6 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.6 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.6 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.6 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  24.6 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.6 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  25.13 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 320 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.48 
 
 		 298 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.06 
 
 		 302 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4898  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 306 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0795  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 316 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.556779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2994  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 306 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5372  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 306 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.06 
 
 		 302 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5417  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 302 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.826157  normal  0.396347 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5895  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 304 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0445545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4463  transcriptional regulator, LysR family  30.96 
 
 		 317 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0335  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 291 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4446  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 306 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.553142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  31.78 
 
 		 296 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0947  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 305 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3599  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601039  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4768  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5515  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  21.31 
 
 		 298 aa  48.9  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0068  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 318 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 404 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 317 aa  48.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  28.65 
 
 		 319 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 414 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  29.36 
 
 		 325 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>