More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0009 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0009  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
523 aa  1048    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0006  ABC transporter, ATP-binding protein  99.81 
 
 
523 aa  1045    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4442  ABC transporter related  90.63 
 
 
523 aa  960    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  43.71 
 
 
534 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  41.11 
 
 
520 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
511 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  39.36 
 
 
509 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  39.76 
 
 
503 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  44.61 
 
 
533 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  40.91 
 
 
514 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  40.63 
 
 
513 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3655  ABC transporter related  43.29 
 
 
509 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  40.16 
 
 
510 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  40.99 
 
 
507 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
524 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  41.85 
 
 
517 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4194  ABC transporter related  42.72 
 
 
515 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  42.08 
 
 
512 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  40.16 
 
 
509 aa  362  8e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
510 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
510 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
510 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  40.67 
 
 
508 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 
510 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 
510 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
510 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
510 aa  360  5e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 
508 aa  359  7e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  39.57 
 
 
509 aa  359  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  38.98 
 
 
510 aa  359  8e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 
510 aa  358  9e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  43.15 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
506 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0916  ABC transporter related  38.81 
 
 
504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0636  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
517 aa  356  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  39.09 
 
 
510 aa  355  7.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  41.22 
 
 
511 aa  355  7.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 
511 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
511 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  40.45 
 
 
510 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  38.65 
 
 
528 aa  353  4e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  41.51 
 
 
527 aa  353  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.46 
 
 
528 aa  352  8e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  38.83 
 
 
515 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  42.13 
 
 
511 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  40.41 
 
 
551 aa  350  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 
507 aa  349  6e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  39.36 
 
 
507 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.36 
 
 
507 aa  348  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  42.01 
 
 
514 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  41.1 
 
 
525 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
521 aa  347  4e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
505 aa  346  5e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 
523 aa  346  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  41.02 
 
 
503 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.45 
 
 
506 aa  344  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 
534 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  40.61 
 
 
516 aa  344  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  38.24 
 
 
510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.57 
 
 
517 aa  344  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  40.52 
 
 
504 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  41.73 
 
 
525 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  40.51 
 
 
520 aa  342  7e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  41.27 
 
 
514 aa  342  7e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  40.44 
 
 
532 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  40.82 
 
 
503 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  41.76 
 
 
551 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  39.21 
 
 
505 aa  341  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  39.37 
 
 
521 aa  340  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  36.38 
 
 
502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  41.96 
 
 
604 aa  340  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 
522 aa  340  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  40.73 
 
 
503 aa  340  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  37.65 
 
 
509 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  41.12 
 
 
558 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  38.05 
 
 
527 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  40.59 
 
 
525 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.59 
 
 
525 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  37.98 
 
 
505 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  41.61 
 
 
529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  39.55 
 
 
524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  38.37 
 
 
510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  39.21 
 
 
534 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  38.25 
 
 
518 aa  337  3.9999999999999995e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  36.04 
 
 
517 aa  333  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  41.54 
 
 
515 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  40.13 
 
 
532 aa  333  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 
511 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
507 aa  332  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  40.04 
 
 
511 aa  331  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  41.07 
 
 
518 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  40.74 
 
 
531 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  41.14 
 
 
541 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  39.56 
 
 
506 aa  330  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  39.3 
 
 
548 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3629  ABC transporter related protein  37.15 
 
 
510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.02 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  39.63 
 
 
491 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
506 aa  326  6e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  39.79 
 
 
513 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>