More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0629 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0629  Xanthine/uracil permease  100 
 
 
454 aa  898    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0040794  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2967  xanthine permease  60.18 
 
 
462 aa  481  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  55.66 
 
 
449 aa  477  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  39.46 
 
 
465 aa  309  6.999999999999999e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.16 
 
 
459 aa  302  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  38.42 
 
 
458 aa  300  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  38.73 
 
 
450 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  37.53 
 
 
487 aa  279  6e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2645  uracil-xanthine permease  34.35 
 
 
460 aa  278  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  34.31 
 
 
479 aa  250  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1498  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.93 
 
 
427 aa  249  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000560897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  36.22 
 
 
474 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  37.78 
 
 
461 aa  243  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  35.57 
 
 
470 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  37.01 
 
 
431 aa  235  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  31.19 
 
 
452 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  33.55 
 
 
478 aa  232  9e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  30.97 
 
 
452 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  32.81 
 
 
452 aa  228  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  33.41 
 
 
466 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  30.3 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  34.7 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  30.92 
 
 
466 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  30.92 
 
 
466 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  30.92 
 
 
466 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  30.92 
 
 
466 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  30.92 
 
 
466 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  30.92 
 
 
466 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  35.65 
 
 
566 aa  211  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  32.62 
 
 
451 aa  210  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  31.88 
 
 
500 aa  210  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  30.7 
 
 
466 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  30.7 
 
 
466 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  30.32 
 
 
458 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  37.53 
 
 
487 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  33.5 
 
 
449 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  31.94 
 
 
438 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  33.26 
 
 
503 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  33.96 
 
 
501 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  30.91 
 
 
453 aa  203  5e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  34.22 
 
 
485 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  33.88 
 
 
497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  32.99 
 
 
445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  35.17 
 
 
413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  34.47 
 
 
509 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  33.5 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  32.88 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  31.91 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  32.2 
 
 
449 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  30.12 
 
 
509 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  30.77 
 
 
465 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  30.12 
 
 
462 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  31.8 
 
 
445 aa  196  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  30.12 
 
 
462 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  32.63 
 
 
468 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  31.17 
 
 
462 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  33.64 
 
 
444 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  29.88 
 
 
462 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  29.88 
 
 
462 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  29.88 
 
 
462 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  32.25 
 
 
463 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  29.88 
 
 
462 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  33.96 
 
 
493 aa  193  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  30.05 
 
 
462 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  29.65 
 
 
462 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  30.05 
 
 
462 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  33.18 
 
 
435 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  33.89 
 
 
438 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  31.28 
 
 
489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  31.34 
 
 
440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  31.11 
 
 
440 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  31.34 
 
 
440 aa  190  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  30.75 
 
 
466 aa  190  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  30.52 
 
 
482 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  30.52 
 
 
482 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  30.52 
 
 
482 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  31.29 
 
 
446 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  30.52 
 
 
482 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  31.87 
 
 
825 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  30.52 
 
 
525 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  30.52 
 
 
482 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  30.52 
 
 
482 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  31.25 
 
 
440 aa  189  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  30.52 
 
 
525 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  31.25 
 
 
440 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  31.4 
 
 
440 aa  189  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  30.64 
 
 
465 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  31.92 
 
 
482 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  36.12 
 
 
455 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  31.25 
 
 
440 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  31.25 
 
 
440 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  31.25 
 
 
440 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  31.25 
 
 
440 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  31.25 
 
 
440 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  32.62 
 
 
496 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  33.17 
 
 
458 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  31.79 
 
 
505 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  33.17 
 
 
458 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  33.17 
 
 
457 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  35.71 
 
 
455 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>