More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1498 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1498  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 427 aa  824    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000560897  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  46.41 
 
 		 487 aa  363  2e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  47.2 
 
 		 450 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2645  uracil-xanthine permease  44.39 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.86 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  34.92 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  35.46 
 
 		 465 aa  265  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  36.64 
 
 		 479 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  36.95 
 
 		 474 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  36.41 
 
 		 478 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  33.18 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0629  Xanthine/uracil permease  32.93 
 
 		 454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0040794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  36.34 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  32.15 
 
 		 452 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  32.15 
 
 		 452 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2967  xanthine permease  36.08 
 
 		 462 aa  225  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  36.59 
 
 		 445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  31.63 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  33.49 
 
 		 461 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  35.73 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  34.12 
 
 		 487 aa  216  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  33.59 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  33.25 
 
 		 505 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  31.98 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  33.25 
 
 		 431 aa  206  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  33.18 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  32.59 
 
 		 463 aa  202  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  32.26 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  33.17 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  34.59 
 
 		 435 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  33.18 
 
 		 460 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  31.78 
 
 		 501 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  33.18 
 
 		 509 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  33.41 
 
 		 503 aa  200  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  31.95 
 
 		 482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  32.3 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  32.34 
 
 		 505 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  32.57 
 
 		 505 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  32.34 
 
 		 505 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  33.97 
 
 		 459 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  32.64 
 
 		 469 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0943  uracil-xanthine permease  31.73 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  31.3 
 
 		 442 aa  193  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  31.46 
 
 		 493 aa  193  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  32.41 
 
 		 469 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1085  xanthine permease  34.05 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  33.58 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  30.55 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  30.79 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  30.88 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  30.55 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  30.99 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  31.5 
 
 		 440 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0068  xanthine permease  32.45 
 
 		 422 aa  189  9e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  32.03 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  31.74 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  31.74 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  31.74 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  31.5 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  31.55 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  31.5 
 
 		 440 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  31.5 
 
 		 440 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  31.5 
 
 		 440 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  31.5 
 
 		 440 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  31.5 
 
 		 440 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  31.5 
 
 		 440 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  32.23 
 
 		 506 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  31.14 
 
 		 825 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  31.04 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  31.4 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  30.82 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  30.38 
 
 		 495 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  30.82 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  32.37 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  31.04 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  31.04 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  29.79 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  29.79 
 
 		 455 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  30.82 
 
 		 461 aa  182  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  30.54 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  31.18 
 
 		 475 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  31.18 
 
 		 475 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  32.29 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  30.33 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  32.62 
 
 		 489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  31.79 
 
 		 469 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  31.96 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  30.07 
 
 		 466 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  32.41 
 
 		 463 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  29.76 
 
 		 452 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  29.45 
 
 		 468 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  30.79 
 
 		 500 aa  179  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  30.81 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0447  uracil-xanthine permease  30.77 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  28.98 
 
 		 525 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  30.81 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0436  uracil-xanthine permease  30.77 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  30.66 
 
 		 488 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  32.7 
 
 		 647 aa  177  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  30.57 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>