72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2511 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  53.93 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  52.22 
 
 		 181 aa  202  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  51.4 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  50 
 
 		 180 aa  194  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  51.96 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  52.78 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  48.31 
 
 		 180 aa  190  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  50.56 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  47.78 
 
 		 180 aa  184  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  48.04 
 
 		 188 aa  184  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  48.04 
 
 		 188 aa  184  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  48.88 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  48.09 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  50.56 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  48.31 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  48.31 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  49.15 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  50 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  53.33 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  51.11 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  52.78 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  49.15 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  48.63 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  45.86 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  46.93 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  47.93 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  47.93 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  45 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  42.46 
 
 		 188 aa  160  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  42.46 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  41.53 
 
 		 218 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  43.9 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  43.55 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  38.38 
 
 		 189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  43.7 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  36.15 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  36.15 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  32.75 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1884  hypothetical protein  33.7 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  39.5 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  32.95 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  40.52 
 
 		 180 aa  88.6  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  30.77 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  36.97 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.94 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  39.55 
 
 		 152 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.94 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  38.94 
 
 		 170 aa  84.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.05 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  38.05 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.05 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.05 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.05 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.05 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  27.04 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  37.17 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  28.4 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  26.47 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  32.23 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1832  oxidase, putative  30.11 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3878  hypothetical protein  29.55 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0218712  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  30.11 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  36 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  29.73 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  25 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  30.17 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  29.91 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  27.1 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 91 aa  51.6  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2617  hypothetical protein  20.69 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.796687  normal  0.318237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>