70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3868 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  100 
 
 
170 aa  348  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  94.12 
 
 
170 aa  328  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  94.12 
 
 
170 aa  328  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  93.53 
 
 
170 aa  327  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  93.53 
 
 
170 aa  326  9e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  92.94 
 
 
170 aa  325  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  92.94 
 
 
170 aa  323  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  92.94 
 
 
170 aa  323  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  92.35 
 
 
170 aa  322  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  92.35 
 
 
170 aa  322  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  86.47 
 
 
170 aa  308  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  57.14 
 
 
180 aa  197  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  57.14 
 
 
180 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  52.38 
 
 
181 aa  174  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  41.76 
 
 
179 aa  142  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  38.46 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  35.38 
 
 
182 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  37.75 
 
 
184 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  33.72 
 
 
181 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  31.98 
 
 
186 aa  97.4  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  31.55 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  37.86 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 
179 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  45 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  35.34 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  38.02 
 
 
176 aa  94.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  34.04 
 
 
180 aa  94.4  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  31.61 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  34.04 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  33.33 
 
 
181 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 
181 aa  90.9  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  35 
 
 
180 aa  90.9  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  29.71 
 
 
188 aa  90.9  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  29.71 
 
 
188 aa  90.9  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  31.93 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  31.93 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  39.66 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  39.66 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  29.71 
 
 
182 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  29.71 
 
 
182 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  31.82 
 
 
180 aa  87.8  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  35 
 
 
181 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  30.34 
 
 
180 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  35.57 
 
 
183 aa  85.1  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  38.94 
 
 
183 aa  84.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  32.45 
 
 
173 aa  84.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  32.67 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  34.48 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  30.72 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  30.72 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  31.65 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  30.67 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  35.29 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  26.29 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  25.14 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  30.23 
 
 
218 aa  77.4  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  28.89 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  28.48 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  29 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  30.83 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  31.3 
 
 
224 aa  67  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  32.14 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  31.71 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  24.44 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2617  hypothetical protein  27.06 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.796687  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 
139 aa  44.7  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  21.62 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  29.73 
 
 
155 aa  40.8  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>