71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2021 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  100 
 
 
186 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  69.35 
 
 
186 aa  266  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  65.41 
 
 
218 aa  247  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  56.97 
 
 
180 aa  201  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  51.08 
 
 
181 aa  191  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  48.39 
 
 
184 aa  190  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  49.46 
 
 
185 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  48.39 
 
 
181 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  50.27 
 
 
180 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  51.08 
 
 
181 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  47.85 
 
 
201 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  51.08 
 
 
181 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  47.85 
 
 
181 aa  185  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  48.11 
 
 
180 aa  184  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  48.92 
 
 
180 aa  184  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  48.65 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  45.95 
 
 
181 aa  178  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  45.65 
 
 
185 aa  177  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  47.57 
 
 
180 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  45.41 
 
 
180 aa  175  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  47.31 
 
 
186 aa  175  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  47.03 
 
 
180 aa  174  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  47.03 
 
 
180 aa  174  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  47.28 
 
 
188 aa  174  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  46.74 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  44.09 
 
 
181 aa  170  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  43.48 
 
 
188 aa  170  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  43.48 
 
 
188 aa  170  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  46.45 
 
 
180 aa  160  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  43.01 
 
 
183 aa  160  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  51.72 
 
 
173 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  43.9 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  48.28 
 
 
173 aa  148  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  42.08 
 
 
179 aa  144  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  41.67 
 
 
189 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  33.12 
 
 
179 aa  101  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 
181 aa  94  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  33.14 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  33.14 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1884  hypothetical protein  32.09 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  35.61 
 
 
184 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 
180 aa  84.3  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.43 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  31.37 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  32.89 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.43 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.43 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  36.13 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.89 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.43 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  35.2 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.89 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  36.36 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.89 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.21 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  35.29 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  32.88 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  31.37 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  31.77 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  29.56 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  26.28 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  37.11 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  26.72 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3878  hypothetical protein  29.84 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0218712  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1832  oxidase, putative  30.5 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  29.21 
 
 
221 aa  59.7  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  25.81 
 
 
180 aa  58.5  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  26.71 
 
 
224 aa  50.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42 
 
 
91 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  28.44 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>