72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2725 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  93.64 
 
 		 173 aa  336  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  51.15 
 
 		 181 aa  183  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  52.05 
 
 		 180 aa  183  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  52.02 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  50.89 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  49.71 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  50.3 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  48.54 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  48.52 
 
 		 180 aa  170  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  48.54 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  47.93 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  47.95 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  47.95 
 
 		 180 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  46.82 
 
 		 180 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  46.82 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  46.82 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  49.11 
 
 		 180 aa  165  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  47.93 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  47.93 
 
 		 185 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  46.15 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  46.2 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  45.56 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  45.61 
 
 		 188 aa  157  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  45.61 
 
 		 188 aa  157  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  44.97 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  46.78 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  47.95 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  51.03 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  51.37 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  45.98 
 
 		 218 aa  150  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  48.28 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  41.52 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  41.52 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  38.86 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 		 180 aa  94  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  34.87 
 
 		 181 aa  94  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  31.87 
 
 		 180 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  33.76 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  37.04 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.77 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.77 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  32.53 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  32.53 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  34.23 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  34.23 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  35 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  39.23 
 
 		 170 aa  85.5  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  32.45 
 
 		 170 aa  84.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  32.93 
 
 		 181 aa  84.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  27.91 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.11 
 
 		 170 aa  84  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.11 
 
 		 170 aa  84  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  33.11 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.11 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  43.24 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.45 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  33.79 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1884  hypothetical protein  31.48 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1832  oxidase, putative  27.84 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3878  hypothetical protein  28.41 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0218712  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  27.81 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  30.57 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  29.17 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  31.82 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  29.81 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  27.54 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  25.31 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2617  hypothetical protein  25.69 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.796687  normal  0.318237 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  25.45 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>