71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06080 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  77.6 
 
 		 185 aa  299  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  74.87 
 
 		 188 aa  293  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  74.33 
 
 		 188 aa  291  5e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  58.15 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  52.81 
 
 		 181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  51.69 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  51.67 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  54.49 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  54.49 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  53.93 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  53.93 
 
 		 181 aa  207  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  53.85 
 
 		 184 aa  207  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  51.11 
 
 		 180 aa  207  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  54.24 
 
 		 181 aa  207  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  52.78 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  52.22 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  52.22 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  50.28 
 
 		 180 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  50.28 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  50.56 
 
 		 180 aa  194  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  53.67 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  53.11 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  47.59 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  49.16 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  48.04 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  45.11 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  47.49 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  43.48 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  46.37 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  44.26 
 
 		 186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  45.61 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  44.44 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  43.48 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1884  hypothetical protein  29.21 
 
 		 178 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  31.82 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.79 
 
 		 170 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.79 
 
 		 170 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.33 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  31.17 
 
 		 180 aa  92  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.79 
 
 		 170 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.79 
 
 		 170 aa  92  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.33 
 
 		 170 aa  92  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.79 
 
 		 170 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.79 
 
 		 170 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  32.65 
 
 		 170 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  28.98 
 
 		 178 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  29.71 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  32.41 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3878  hypothetical protein  29.55 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0218712  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  35.29 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1832  oxidase, putative  29.55 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  30.11 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  33.57 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  29.3 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  27.78 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  26.71 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  26.83 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  29.92 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  31.3 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  31.3 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  23.35 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  30.56 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  30.3 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  27.97 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  30.56 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  30.77 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  21.47 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2617  hypothetical protein  22.73 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.796687  normal  0.318237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>