38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2617 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2617  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.796687  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  26.78 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  27.18 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  27.18 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  30.53 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  27.06 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  27.06 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  27.06 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  27.06 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  27.06 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  27.06 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  27.06 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  27.06 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  27.06 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  27.06 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  25.88 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  23.85 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  27.78 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  27.47 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  22.73 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  22.73 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  25.69 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  27.47 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  25.56 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  25.56 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  22.4 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  25.56 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  21.86 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  20.69 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  25 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  29.41 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  26.14 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  23.85 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  18.75 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  22.47 
 
 		 184 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  21.64 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  25.27 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>