71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_21601 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  100 
 
 
218 aa  454  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  65.95 
 
 
186 aa  249  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  65.41 
 
 
186 aa  247  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  57.84 
 
 
180 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  54.59 
 
 
180 aa  203  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  51.09 
 
 
180 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  50.54 
 
 
180 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  48.91 
 
 
184 aa  194  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  51.09 
 
 
180 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  50.54 
 
 
180 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  50.54 
 
 
180 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  48.91 
 
 
181 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  49.46 
 
 
180 aa  191  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  49.46 
 
 
181 aa  191  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  48.37 
 
 
181 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  52.53 
 
 
185 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  50.54 
 
 
181 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  50.54 
 
 
181 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  46.99 
 
 
185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  48.13 
 
 
201 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  47.28 
 
 
181 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  47.28 
 
 
180 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  46.74 
 
 
181 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  45.11 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  45.11 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  46.74 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  46.96 
 
 
188 aa  171  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  46.96 
 
 
188 aa  171  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  43.65 
 
 
180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  45.98 
 
 
173 aa  154  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  41.53 
 
 
183 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  45.98 
 
 
173 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  44.3 
 
 
183 aa  148  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  40.33 
 
 
179 aa  141  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  39.78 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  30.86 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1884  hypothetical protein  30.43 
 
 
178 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  31.46 
 
 
170 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.79 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  31.91 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  31.79 
 
 
180 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  31.46 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  31.46 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  30.32 
 
 
178 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.79 
 
 
170 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.79 
 
 
170 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  31.14 
 
 
184 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  30.34 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1832  oxidase, putative  31.89 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  31.87 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  30.19 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3878  hypothetical protein  31.91 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0218712  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  29.78 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  29.78 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  31.43 
 
 
182 aa  79  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  31.43 
 
 
182 aa  79  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  30.23 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  29.38 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  29.8 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  37.62 
 
 
165 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  30.23 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  35.78 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  30.28 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  34.34 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  25.3 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  27.1 
 
 
180 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  29.17 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  26.83 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  29.13 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.48 
 
 
91 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>