66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0853 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  93.33 
 
 
180 aa  345  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  66.86 
 
 
181 aa  247  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  60.12 
 
 
170 aa  205  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  58.93 
 
 
170 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  58.33 
 
 
170 aa  202  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  58.93 
 
 
170 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  58.93 
 
 
170 aa  203  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  58.93 
 
 
170 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  58.93 
 
 
170 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  58.33 
 
 
170 aa  202  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  58.33 
 
 
170 aa  201  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  57.74 
 
 
170 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  57.14 
 
 
170 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  42.05 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  35.42 
 
 
180 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  34.42 
 
 
181 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  36.48 
 
 
181 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  36.24 
 
 
185 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  33.78 
 
 
180 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  34.21 
 
 
181 aa  101  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  33.78 
 
 
180 aa  101  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  36.36 
 
 
201 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  33.92 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  36.73 
 
 
179 aa  98.2  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  34.42 
 
 
180 aa  97.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  38.56 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  33.12 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  33.33 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  37.91 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  32.18 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  33.12 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  31.82 
 
 
188 aa  95.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  31.82 
 
 
188 aa  95.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 
173 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  30.72 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  30.41 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  30.41 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  30.72 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  30.72 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  32.03 
 
 
173 aa  90.9  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  39.5 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  30.41 
 
 
182 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  31.08 
 
 
180 aa  88.6  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  32.89 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  41.59 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  30.63 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  32.48 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  33.11 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  33.99 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  31.37 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  31.79 
 
 
218 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  30.99 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  31.45 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  32.79 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  32.79 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  30.19 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  33.6 
 
 
224 aa  67  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  29.53 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  35.85 
 
 
165 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  32.41 
 
 
221 aa  62  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  35.96 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  32.41 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  27.16 
 
 
189 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  23.12 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2617  hypothetical protein  21.86 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.796687  normal  0.318237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>