66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0987 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  48.39 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  44.51 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  48.11 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  43.48 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  43.48 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  42.86 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  45.76 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  41.27 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  40.64 
 
 		 180 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  42.86 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  42.93 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  40.22 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  42.47 
 
 		 181 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  38.59 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  38.59 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  38.04 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  41.94 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  38.04 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  40.86 
 
 		 201 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  39.46 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  40.32 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  42.49 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  39.78 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  43.41 
 
 		 179 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  37.91 
 
 		 180 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  37.91 
 
 		 180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  37.91 
 
 		 180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  40.11 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  40 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  40.32 
 
 		 218 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  42.55 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  38.1 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  40 
 
 		 173 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  37.14 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  30.95 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  24.6 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3878  hypothetical protein  28.88 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0218712  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  28.42 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  31.55 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  30.36 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1832  oxidase, putative  28.34 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  31.55 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  31.55 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  31.55 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  30.95 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  31.71 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  30.95 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  30.95 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  30.95 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  30.36 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  29.17 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  30.86 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  28.32 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  32.87 
 
 		 152 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  31.11 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  24.24 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  23.7 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  29.05 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  29.05 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1884  hypothetical protein  35.87 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  30.25 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  29.01 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  26.51 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  38.46 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  34.25 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>