72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2624 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  100 
 
 		 180 aa  373  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  66.48 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  60.89 
 
 		 201 aa  231  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  59.78 
 
 		 181 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  61.45 
 
 		 181 aa  227  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  58.66 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  58.15 
 
 		 188 aa  225  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  58.15 
 
 		 188 aa  225  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  61.45 
 
 		 185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  55.87 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  55.87 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  61.02 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  61.02 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  54.44 
 
 		 180 aa  214  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  55 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  57.3 
 
 		 186 aa  214  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  55 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  55 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  53.63 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  54.44 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  56.42 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  53.07 
 
 		 188 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  55.87 
 
 		 184 aa  210  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  58.19 
 
 		 180 aa  208  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  53.63 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  54.24 
 
 		 183 aa  204  5e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  51.4 
 
 		 183 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  54.49 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  50.27 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  51.46 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  52.05 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  48.65 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  47.28 
 
 		 218 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  49.72 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  47.85 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1884  hypothetical protein  34.81 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  33.7 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  37.01 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1832  oxidase, putative  34.66 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  30.3 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  36.36 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  34.86 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3878  hypothetical protein  34.09 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0218712  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  30.59 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  31.52 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  37.14 
 
 		 170 aa  97.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  34.42 
 
 		 180 aa  97.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  35.33 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  37.86 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  35.33 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  35.1 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  35.1 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  35.33 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36.62 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36.62 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  29.7 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  34.67 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  36.36 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  35.66 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  41.07 
 
 		 152 aa  88.2  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  35.66 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  24.12 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  33.66 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  37.37 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  20.37 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  29.31 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  28.87 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  33.03 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44 
 
 		 91 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 364 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>