72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3319 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  100 
 
 		 180 aa  377  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  99.44 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  99.44 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  82.12 
 
 		 180 aa  316  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  74.44 
 
 		 180 aa  291  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  72.63 
 
 		 180 aa  286  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  73.89 
 
 		 181 aa  285  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  72.78 
 
 		 180 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  71.51 
 
 		 181 aa  275  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  55.87 
 
 		 180 aa  218  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  56.42 
 
 		 181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  55 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  55.87 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  51.96 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  54.19 
 
 		 181 aa  208  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  55.06 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  52.78 
 
 		 188 aa  203  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  52.78 
 
 		 188 aa  203  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  53.63 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  51.69 
 
 		 188 aa  198  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  51.69 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  50.56 
 
 		 180 aa  197  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  51.4 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  51.09 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  50.28 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  50.56 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  49.72 
 
 		 183 aa  185  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  48.88 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  49.19 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  49.44 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  46.89 
 
 		 179 aa  175  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  47.57 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  47.06 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  46.82 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  37.91 
 
 		 189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  32.68 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  30.72 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  31.29 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  31.46 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  34.87 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  34 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  34 
 
 		 170 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.33 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1884  hypothetical protein  29.44 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.33 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  33.33 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  32.67 
 
 		 170 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.67 
 
 		 170 aa  85.5  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  34.04 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  34.04 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  30.34 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3878  hypothetical protein  30.34 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0218712  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  30.67 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1832  oxidase, putative  29.78 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  30.46 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  28.57 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  27.95 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  32.62 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  30.66 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  30.66 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  27.95 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  24.7 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  34.55 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  30.05 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  31.48 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  27.78 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  31.11 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  32.71 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  21.38 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2617  hypothetical protein  25.56 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.796687  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.65 
 
 		 91 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>