72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3301 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  100 
 
 		 181 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  94.48 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  81.01 
 
 		 180 aa  313  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  79.44 
 
 		 180 aa  309  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  75.42 
 
 		 180 aa  295  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  73.89 
 
 		 180 aa  285  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  73.33 
 
 		 180 aa  283  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  73.33 
 
 		 180 aa  283  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  70.39 
 
 		 180 aa  281  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  59.22 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  58.1 
 
 		 181 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  55.87 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  57.54 
 
 		 201 aa  220  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  55 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  52.81 
 
 		 188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  52.81 
 
 		 188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  55.87 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  55.87 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  51.96 
 
 		 184 aa  214  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  53.63 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  54.75 
 
 		 181 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  50 
 
 		 188 aa  207  6e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  50 
 
 		 188 aa  207  8e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  53.93 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  50.28 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  51.12 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  48.91 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  48.11 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  50.84 
 
 		 186 aa  184  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  45.95 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  46.89 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  44.63 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  45.56 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  45.56 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  38.59 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  35.71 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  32.96 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  34.42 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  34.9 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3878  hypothetical protein  33.52 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0218712  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  33.52 
 
 		 178 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36.67 
 
 		 170 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1884  hypothetical protein  32.4 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36 
 
 		 170 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1832  oxidase, putative  32.39 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  35.33 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  35.33 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  32.26 
 
 		 170 aa  91.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 		 170 aa  90.9  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  31.18 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  30.86 
 
 		 179 aa  88.2  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  30.19 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  31.58 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  31.58 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  29.56 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  27.67 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  33.63 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  35.19 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  25.97 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  21.89 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  32.58 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  26.97 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  21.15 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  29.46 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.48 
 
 		 91 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2617  hypothetical protein  21.64 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.796687  normal  0.318237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>