More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1034 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1034  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
476 aa  978    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.31032  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2996  exodeoxyribonuclease VII large subunit  54.74 
 
 
527 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0712  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.79 
 
 
511 aa  527  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0764  exodeoxyribonuclease VII large subunit  56.79 
 
 
511 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.81 
 
 
526 aa  505  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0182  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.53 
 
 
519 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4284  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.67 
 
 
527 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671183  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4549  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.78 
 
 
526 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.6 
 
 
543 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  54.16 
 
 
477 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.8 
 
 
496 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.51 
 
 
537 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0398  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.29 
 
 
521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.636778 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.17 
 
 
541 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.76 
 
 
541 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1238  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.79 
 
 
549 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122237  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6068  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.33 
 
 
507 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0339601  normal  0.285374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.71 
 
 
536 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0667  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.65 
 
 
566 aa  438  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1859  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.34 
 
 
538 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.020819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4330  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.86 
 
 
548 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554584  normal  0.651535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4621  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.37 
 
 
541 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6605  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.37 
 
 
531 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1695  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.45 
 
 
536 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3873  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.74 
 
 
522 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.0839806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4183  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.86 
 
 
523 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.14 
 
 
519 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1845  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.55 
 
 
519 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.264563  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0494  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.05 
 
 
519 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0628  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.95 
 
 
485 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.088972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3300  exodeoxyribonuclease VII large subunit  53.16 
 
 
519 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50 
 
 
519 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2727  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  41.65 
 
 
523 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0564335  normal  0.143765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1945  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.61 
 
 
502 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.11 
 
 
475 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.29 
 
 
492 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0171  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.37 
 
 
453 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0159  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.21 
 
 
537 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1226  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.32 
 
 
528 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.901078  normal  0.0774047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1331  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.7 
 
 
462 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.701446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2864  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.3 
 
 
486 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265405  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.42 
 
 
388 aa  291  2e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.66 
 
 
388 aa  291  2e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.44 
 
 
453 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.35 
 
 
475 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.67 
 
 
455 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.18 
 
 
452 aa  264  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.18 
 
 
452 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.18 
 
 
452 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.86 
 
 
453 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.18 
 
 
452 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.29 
 
 
448 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.53 
 
 
452 aa  262  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.53 
 
 
452 aa  262  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.53 
 
 
452 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.53 
 
 
452 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.53 
 
 
452 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.1 
 
 
451 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.87 
 
 
452 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36 
 
 
454 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.03 
 
 
404 aa  257  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.15 
 
 
398 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.82 
 
 
398 aa  252  9.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.87 
 
 
448 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.99 
 
 
422 aa  250  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.57 
 
 
458 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.72 
 
 
411 aa  249  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.82 
 
 
458 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.37 
 
 
401 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1184  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.68 
 
 
446 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.389235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.86 
 
 
449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.09 
 
 
449 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.95 
 
 
396 aa  243  5e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.09 
 
 
449 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.81 
 
 
458 aa  243  7.999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.7 
 
 
405 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.86 
 
 
449 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.62 
 
 
447 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.86 
 
 
449 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.29 
 
 
465 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.56 
 
 
469 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.93 
 
 
411 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.36 
 
 
407 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.27 
 
 
461 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.69 
 
 
542 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.95 
 
 
457 aa  240  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.7 
 
 
445 aa  240  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.7 
 
 
445 aa  240  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.69 
 
 
542 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.3 
 
 
446 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.53 
 
 
457 aa  239  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.96 
 
 
445 aa  238  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.88 
 
 
423 aa  237  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.18 
 
 
402 aa  236  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.71 
 
 
456 aa  236  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.97 
 
 
403 aa  236  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.26 
 
 
456 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.26 
 
 
456 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.71 
 
 
456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  33.26 
 
 
456 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>