42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7352 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  175  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  70.73 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  69.51 
 
 		 85 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  66.27 
 
 		 109 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  64.2 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  55.56 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  50 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  50 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  51.47 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  51.39 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  48.65 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  46.58 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  49.32 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  45.83 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  53.85 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  53.85 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  47.14 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  51.85 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  54.24 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  44 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  40.54 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  40.54 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  46.15 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  42.65 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  44.78 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  38.57 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  35.14 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  42.86 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  43.06 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  36.23 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  33.33 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  38.89 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  37.5 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  35.29 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  44.68 
 
 		 1822 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  31.43 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2748  WGR domain-containing protein  40 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.393402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1085  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  41.67 
 
 		 1314 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  35.38 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  31.43 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>