33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3178 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  100 
 
 
89 aa  178  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  57.65 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  55.81 
 
 
98 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  51.9 
 
 
84 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3272  WGR domain-containing protein  54.02 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.705915  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  50.59 
 
 
86 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  50.67 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  51.43 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  47.06 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  47.06 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  47.95 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  47.14 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  42.86 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  43.06 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  44.12 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  45.45 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  47.3 
 
 
76 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  46.15 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  46.15 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  50 
 
 
81 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  38.46 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  40.79 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  40.85 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  47.37 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  39.71 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  39.71 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  37.66 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  39.73 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  34.18 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  40 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  33.33 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>