40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6815 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  100 
 
 		 81 aa  166  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  97.53 
 
 		 81 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  96.3 
 
 		 81 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  65.38 
 
 		 102 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  63.64 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  57.69 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  58.02 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  62.82 
 
 		 184 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  55.84 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  53.95 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  63.33 
 
 		 70 aa  87.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  55.71 
 
 		 85 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  52.78 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  52.78 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  46.05 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  46.75 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  46.67 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  51.43 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  53.85 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  48.57 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  48.57 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  48.57 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  43.66 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  39.74 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  41.98 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  42.25 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  41.43 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  41.67 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  41.43 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  44.16 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  32.43 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  40.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  40.58 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  31.94 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  37.14 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  36.92 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3272  WGR domain-containing protein  36.49 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.705915  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0110  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  30.14 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  47.62 
 
 		 1314 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>