39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9587 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  65.49 
 
 		 184 aa  146  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  69.88 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  53.61 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  61.25 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  59.26 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  58.02 
 
 		 81 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  58.02 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  46.08 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  55.38 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  45 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  37.86 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  47.3 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  49.32 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  49.37 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  47.22 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  45.71 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  48.53 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  48.53 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  44.29 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  40.7 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  51.43 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  41.43 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  40.54 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  40.24 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  39.44 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  43.28 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  38.46 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  35.21 
 
 		 74 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  40.79 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  30 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  30 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3272  WGR domain-containing protein  51.22 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.705915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  41.54 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  37.74 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  28.57 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  30.99 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  37.5 
 
 		 1329 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  36.92 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>