32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7047 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  143  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  90 
 
 		 102 aa  130  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  55.38 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  58.06 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  57.38 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  53.23 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  54.84 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  54.1 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  57.63 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  63.33 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  62.3 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  55.93 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  63.33 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  55.93 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  52.54 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  52.54 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  54.24 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  52.54 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  52.54 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  51.52 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  48.33 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  50 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  46.67 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  51.72 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  48.33 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  37.93 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  44.26 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  41.27 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  38.98 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  47.37 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  36.21 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  31.67 
 
 		 98 aa  40.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>