33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3272 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3272  WGR domain-containing protein  100 
 
 
88 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.705915  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  54.02 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  51.9 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  45 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  45.24 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  47.22 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  46.15 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  41.1 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  40 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  45.07 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  40.79 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  36.11 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  38.57 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  38.36 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  43.75 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  35.53 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  34.29 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  34.29 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  35.9 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  34.25 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  38.55 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  35.62 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  39.06 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  35.06 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  35.06 
 
 
81 aa  43.9  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  35.21 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  35.21 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  36.99 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  34.72 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  35.21 
 
 
74 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  32.88 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  36.99 
 
 
184 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  36.84 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>