40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4085 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 84 aa  170  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  55.95 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  55.7 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  53.75 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  45.95 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  48.65 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  48.61 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  51.9 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  44.74 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  44.16 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  47.22 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  47.22 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  47.3 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  46.05 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  47.37 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  49.32 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  49.25 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  42.67 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  42.67 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3272  WGR domain-containing protein  51.9 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.705915  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  45.71 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  49.3 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  48.33 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  41.1 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  40.54 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  39.44 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  38.36 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  41.33 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  37.66 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  33.8 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  41.1 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  35.21 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0110  hypothetical protein  43.94 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  37.68 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  40.58 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02180  hypothetical protein  39.71 
 
 		 83 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  41.82 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  39.13 
 
 		 87 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>