31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4040 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 86 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  63.95 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  42.67 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  40.54 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  37.33 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  40.54 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  38.96 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  38.03 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  36.76 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  37.14 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  37.14 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  41.43 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  40.28 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  46 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  40.28 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  33.33 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  35.21 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  52.38 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  39.71 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  33.8 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  39.71 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  32.39 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  35.71 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  30 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1422 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  40 
 
 		 1838 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  42.59 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3272  WGR domain-containing protein  48.72 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.705915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>