18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0022 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  300  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  67.53 
 
 
86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  36.62 
 
 
114 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  39.29 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  37.74 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  39.62 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  39.62 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  33.85 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  39.62 
 
 
81 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  35.85 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  35.38 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  40.43 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  38.89 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  35.71 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  35.85 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  42.59 
 
 
86 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  42.59 
 
 
86 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>