40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0010 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  201  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  60.42 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  71.6 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  52.75 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  63.64 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  55.56 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  56.94 
 
 		 87 aa  87.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  56.94 
 
 		 87 aa  87.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  53.42 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  52.7 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  46.84 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  53.95 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  53.95 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  54.05 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  46.67 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  44.74 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  47.3 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  45.95 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  57.63 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  45.71 
 
 		 83 aa  67  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  41.11 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  46.67 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  38.96 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  38.96 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  40.85 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  42.47 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  39.74 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  40.85 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  42.47 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  47.95 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  38.57 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  35.29 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2748  WGR domain-containing protein  40.68 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.393402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1085  hypothetical protein  40.68 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  42.22 
 
 		 1822 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  36.92 
 
 		 1422 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>