36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5799 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 90 aa  186  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  49.37 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  49.37 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  50.63 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  51.25 
 
 		 184 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  49.37 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  51.85 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  53.85 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  53.85 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  51.52 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  48.75 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  43.9 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  47.5 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  46.67 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  44.16 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  45.71 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  47.76 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  47.76 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  44.29 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  45.71 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  44.29 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  43.66 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  37.68 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  43.48 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  38.57 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  37.14 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  40.98 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  37.14 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  43.28 
 
 		 84 aa  48.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  39.13 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  39.13 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  35.9 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  38.27 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2037  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  38.82 
 
 		 87 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>