19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0289 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  89.41 
 
 		 88 aa  160  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  48.81 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  40.58 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  38.89 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  38.03 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  41.54 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  35.29 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  35.06 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  41.79 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  35.82 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  33.78 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  38.46 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  46.51 
 
 		 1291 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  38.46 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  38.46 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  38.46 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  45.95 
 
 		 1329 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  39.13 
 
 		 84 aa  40  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>