20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0231 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 88 aa  184  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  89.41 
 
 		 87 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  45.24 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  42.03 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  36.36 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  38.89 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  36.92 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  34.33 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  39.13 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  37.66 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  40.58 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  33.78 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  33.33 
 
 		 98 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  35.14 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  35.14 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  36.92 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  36.92 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  40.91 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  48.65 
 
 		 1329 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>