23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3691 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  100 
 
 
84 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  48.81 
 
 
87 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  45.24 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  38.89 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  37.84 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  36.62 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  38.36 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  38.36 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  38.57 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  36.76 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  38.57 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  35.82 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  40.58 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  42.03 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  35.21 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  41.18 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  31.25 
 
 
85 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  41.27 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  36.21 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  34.72 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  33.78 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  33.82 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.313647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>