37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2726 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  100 
 
 
98 aa  200  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  85.71 
 
 
98 aa  168  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  53.75 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  55.81 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  48.61 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  47.14 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  48.57 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  48.57 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  46.58 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  53.33 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  44.44 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  41.89 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  51.72 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  33.68 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  42.47 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  36.76 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  36.76 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3272  WGR domain-containing protein  45.24 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.705915  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  43.28 
 
 
112 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  39.74 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  41.18 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  41.27 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  42.03 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  36.84 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  34.43 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  36.92 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  39.68 
 
 
94 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  33.82 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  47.73 
 
 
1422 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  37.68 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  39.39 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  35.29 
 
 
1291 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02180  hypothetical protein  36.23 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  36.73 
 
 
1264 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>