24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3303 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  167  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  63.95 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  63.95 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  39.19 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  39.74 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  41.33 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  32 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  35.14 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  37.33 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  35.21 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  33.8 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  33.82 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  35.21 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  32.35 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  35.29 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  33.8 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  38.89 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  33.8 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  43.48 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  45.45 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  45.45 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  30.99 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  38.89 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>