20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3038 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  158  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02180  hypothetical protein  62.03 
 
 
83 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  41.1 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  44.93 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  31.94 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  29.33 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  32.86 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  39.66 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  36.11 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  37.68 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  32.86 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2037  hypothetical protein  38.71 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  32.88 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  32.88 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  32.86 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  31.43 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  32.86 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  33.8 
 
 
86 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  32.86 
 
 
109 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>