11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2748 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1085  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2748  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 81 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.393402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0110  hypothetical protein  54.1 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  40 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  40.68 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  37.7 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  40.68 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  38.33 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  38.33 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  38.98 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>