51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1108 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1257  hypothetical protein  46.44 
 
 		 258 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  46.41 
 
 		 272 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  44.03 
 
 		 245 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  45.09 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  46.19 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  45.08 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1370  hypothetical protein  45.93 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  45.23 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1002  Protein of unknown function DUF2257  43 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0448  hypothetical protein  41.3 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0049207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  43.3 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3616  hypothetical protein  41.18 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  40.2 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  37.5 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2762  hypothetical protein  41.12 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  37.5 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4357  hypothetical protein  34.41 
 
 		 260 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.486067  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  39.7 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  36.57 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  37.78 
 
 		 270 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  36.68 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1770  hypothetical protein  38.07 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000622188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  38.27 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  38.27 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  38.27 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  34.67 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  28.5 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  33.5 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0804  hypothetical protein  32.7 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  29.19 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2820  hypothetical protein  31.22 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130722  normal  0.950344 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0880  cell aggregate formation protein, biofilm development BsmA  31.41 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  31.47 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  28.12 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1459  hypothetical protein  30.73 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5565  hypothetical protein  25.91 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0125413  normal  0.0140132 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5771  hypothetical protein  26.96 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.134868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5089  hypothetical protein  26.96 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3325  Protein of unknown function DUF2257  28.64 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4209  hypothetical protein  24.29 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1710  hypothetical protein  26.54 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1298  hypothetical protein  26.54 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0273  hypothetical protein  26.54 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1796  hypothetical protein  26.54 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1096  hypothetical protein  25.21 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.584579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0297  hypothetical protein  26.54 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76128  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1020  hypothetical protein  26.54 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3952  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26530  hypothetical protein  34.62 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>